Microsoft membenamkan sistem operasi Windows 10 mobile kedalam Lumia 550. Sistem operasi ini memakan ruang sebesar 5 GB, sehingga kapasitas internal smartphone ini hanya tersisa 3 GB, untungnya Microsoft memberikan pilihan penambahan microSD didalamnya.

Tampilan user interface dari Lumia 550 secara umum hampir sama dengan smartphone Windows lain, yaitu dengan fitur live tile homescreen.

Untuk browsing web, Lumia 550 dilengkapi dengan browser Edge. Browser Edge diketahui lebih ringan dan cepat dibanding versi Internet Explorer 11, yang sebelumnya sudah digunakan pada versi Windows yang lebih lama.

Untuk mendukung produktivitas pengguna, Lumia 550 sudah dilengkapi dengan pre-instaled software produktivitas seperti Word, Excel, PowerPoint dan OneNote. Selain itu, aplikasi lain seperti kalender, alarm dan kalkulator sudah ada didalamnya.